Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms