Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fip1l1Q9D824 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms