Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms