Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms