Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms