Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gabra4Q9D6F4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gabra4Q9D6F4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gabra4Q9D6F4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gabra4Q9D6F4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gabra4Q9D6F4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gabra4Q9D6F4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gabra4Q9D6F4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gabra4Q9D6F4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gabra4Q9D6F4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gabra4Q9D6F4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gabra4Q9D6F4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra4Q9D6F4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms