Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms