Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms