Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PrameQ9D4Z5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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