Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tubgcp4Q9D4F8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tubgcp4Q9D4F8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tubgcp4Q9D4F8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tubgcp4Q9D4F8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tubgcp4Q9D4F8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tubgcp4Q9D4F8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tubgcp4Q9D4F8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tubgcp4Q9D4F8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tubgcp4Q9D4F8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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