Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms