Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Snx29Q9D3S3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Snx29Q9D3S3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Snx29Q9D3S3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Snx29Q9D3S3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Snx29Q9D3S3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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