Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt20Q9D312 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt20Q9D312 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt20Q9D312 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt20Q9D312 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt20Q9D312 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt20Q9D312 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt20Q9D312 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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