Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D2Q3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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