Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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