Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms