Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms