Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2fQ9CY34 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms