Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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