Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Utp23Q9CX11 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Utp23Q9CX11 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Utp23Q9CX11 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Utp23Q9CX11 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Utp23Q9CX11 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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