Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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