Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pin4Q9CWW6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pin4Q9CWW6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pin4Q9CWW6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pin4Q9CWW6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pin4Q9CWW6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms