Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms