Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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