Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb2bQ9CWF2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms