Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sppl3Q9CUS9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl3Q9CUS9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms