Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms