Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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