Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dis3Q9CSH3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms