Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms