Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms