Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb9Q9CQJ8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms