Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Tmed6Q9CQG0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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