Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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