Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms