Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms