Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rnaseh2cQ9CQ18 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rnaseh2cQ9CQ18 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rnaseh2cQ9CQ18 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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