Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms