Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms