Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubqln4Q99NB8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubqln4Q99NB8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubqln4Q99NB8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubqln4Q99NB8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubqln4Q99NB8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ubqln4Q99NB8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ubqln4Q99NB8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ubqln4Q99NB8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms