Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q99LU8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q99LU8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q99LU8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q99LU8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q99LU8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q99LU8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q99LU8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q99LU8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Q99LU8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q99LU8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q99LU8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q99LU8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q99LU8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q99LU8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms