Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vmp1Q99KU0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms