Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed9Q99KF1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms