Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip1Q922J3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms