Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms