Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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