Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms