Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms