Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cacng8Q8VHW2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms