Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms